Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk5r1P61809 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5r1P61809 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5r1P61809 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5r1P61809 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5r1P61809 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5r1P61809 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk5r1P61809 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk5r1P61809 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk5r1P61809 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms