Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Smg6P61406 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Smg6P61406 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Smg6P61406 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Smg6P61406 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Smg6P61406 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smg6P61406 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smg6P61406 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smg6P61406 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smg6P61406 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smg6P61406 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smg6P61406 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Smg6P61406 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smg6P61406 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Smg6P61406 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Smg6P61406 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smg6P61406 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Smg6P61406 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Smg6P61406 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Smg6P61406 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smg6P61406 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smg6P61406 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Smg6P61406 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Smg6P61406 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Smg6P61406 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Smg6P61406 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smg6P61406 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smg6P61406 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smg6P61406 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Smg6P61406 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smg6P61406 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smg6P61406 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smg6P61406 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smg6P61406 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smg6P61406 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Smg6P61406 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smg6P61406 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smg6P61406 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smg6P61406 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smg6P61406 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smg6P61406 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smg6P61406 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smg6P61406 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smg6P61406 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smg6P61406 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smg6P61406 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smg6P61406 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smg6P61406 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smg6P61406 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smg6P61406 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Smg6P61406 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smg6P61406 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smg6P61406 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Smg6P61406 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Smg6P61406 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smg6P61406 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smg6P61406 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smg6P61406 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smg6P61406 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Smg6P61406 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smg6P61406 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smg6P61406 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smg6P61406 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Smg6P61406 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Smg6P61406 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms