Protein–RNA interactions for Protein: P60954

Nol4, Nucleolar protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol4P60954 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nol4P60954 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nol4P60954 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nol4P60954 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nol4P60954 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nol4P60954 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nol4P60954 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Nol4P60954 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nol4P60954 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nol4P60954 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nol4P60954 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nol4P60954 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nol4P60954 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Nol4P60954 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nol4P60954 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Nol4P60954 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nol4P60954 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nol4P60954 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nol4P60954 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nol4P60954 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nol4P60954 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nol4P60954 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nol4P60954 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nol4P60954 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nol4P60954 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nol4P60954 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nol4P60954 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nol4P60954 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nol4P60954 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nol4P60954 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nol4P60954 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nol4P60954 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nol4P60954 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nol4P60954 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nol4P60954 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Nol4P60954 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nol4P60954 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nol4P60954 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nol4P60954 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol4P60954 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol4P60954 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nol4P60954 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nol4P60954 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nol4P60954 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nol4P60954 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nol4P60954 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nol4P60954 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nol4P60954 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nol4P60954 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nol4P60954 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nol4P60954 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nol4P60954 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nol4P60954 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nol4P60954 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nol4P60954 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nol4P60954 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nol4P60954 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nol4P60954 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nol4P60954 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nol4P60954 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nol4P60954 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nol4P60954 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nol4P60954 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nol4P60954 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nol4P60954 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nol4P60954 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nol4P60954 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms