Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sem1P60897 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sem1P60897 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sem1P60897 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sem1P60897 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sem1P60897 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sem1P60897 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sem1P60897 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sem1P60897 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sem1P60897 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sem1P60897 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sem1P60897 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sem1P60897 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sem1P60897 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sem1P60897 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sem1P60897 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sem1P60897 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms