Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcmtd1P59913 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcmtd1P59913 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcmtd1P59913 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcmtd1P59913 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcmtd1P59913 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcmtd1P59913 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcmtd1P59913 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcmtd1P59913 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pcmtd1P59913 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcmtd1P59913 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcmtd1P59913 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcmtd1P59913 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcmtd1P59913 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcmtd1P59913 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcmtd1P59913 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcmtd1P59913 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pcmtd1P59913 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pcmtd1P59913 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcmtd1P59913 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcmtd1P59913 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcmtd1P59913 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcmtd1P59913 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcmtd1P59913 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcmtd1P59913 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcmtd1P59913 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcmtd1P59913 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcmtd1P59913 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcmtd1P59913 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcmtd1P59913 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcmtd1P59913 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcmtd1P59913 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcmtd1P59913 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcmtd1P59913 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcmtd1P59913 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcmtd1P59913 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms