Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CgnP59242 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CgnP59242 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CgnP59242 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CgnP59242 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CgnP59242 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CgnP59242 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CgnP59242 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CgnP59242 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CgnP59242 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CgnP59242 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CgnP59242 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CgnP59242 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CgnP59242 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CgnP59242 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CgnP59242 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CgnP59242 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CgnP59242 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CgnP59242 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CgnP59242 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CgnP59242 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CgnP59242 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CgnP59242 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CgnP59242 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CgnP59242 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CgnP59242 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CgnP59242 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CgnP59242 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CgnP59242 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CgnP59242 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CgnP59242 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CgnP59242 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CgnP59242 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CgnP59242 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CgnP59242 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CgnP59242 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CgnP59242 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CgnP59242 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CgnP59242 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CgnP59242 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CgnP59242 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CgnP59242 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CgnP59242 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CgnP59242 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CgnP59242 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CgnP59242 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CgnP59242 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CgnP59242 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CgnP59242 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CgnP59242 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CgnP59242 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CgnP59242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CgnP59242 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CgnP59242 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CgnP59242 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CgnP59242 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CgnP59242 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CgnP59242 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CgnP59242 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CgnP59242 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CgnP59242 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CgnP59242 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CgnP59242 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CgnP59242 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CgnP59242 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CgnP59242 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CgnP59242 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CgnP59242 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CgnP59242 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CgnP59242 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CgnP59242 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CgnP59242 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CgnP59242 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CgnP59242 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CgnP59242 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CgnP59242 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CgnP59242 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CgnP59242 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CgnP59242 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CgnP59242 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CgnP59242 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CgnP59242 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CgnP59242 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CgnP59242 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CgnP59242 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CgnP59242 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CgnP59242 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CgnP59242 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CgnP59242 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CgnP59242 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CgnP59242 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CgnP59242 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CgnP59242 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CgnP59242 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms