Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcbp3P57722 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp3P57722 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp3P57722 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp3P57722 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp3P57722 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcbp3P57722 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcbp3P57722 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcbp3P57722 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcbp3P57722 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcbp3P57722 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcbp3P57722 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcbp3P57722 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcbp3P57722 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcbp3P57722 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcbp3P57722 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcbp3P57722 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcbp3P57722 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcbp3P57722 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcbp3P57722 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcbp3P57722 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp3P57722 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp3P57722 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp3P57722 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp3P57722 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp3P57722 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms