Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efnb1P52795 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Efnb1P52795 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Efnb1P52795 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efnb1P52795 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efnb1P52795 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efnb1P52795 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efnb1P52795 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efnb1P52795 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efnb1P52795 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efnb1P52795 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Efnb1P52795 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Efnb1P52795 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Efnb1P52795 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efnb1P52795 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efnb1P52795 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efnb1P52795 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efnb1P52795 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efnb1P52795 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efnb1P52795 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efnb1P52795 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Efnb1P52795 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efnb1P52795 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efnb1P52795 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efnb1P52795 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms