Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1cP52432 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1cP52432 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1cP52432 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr1cP52432 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr1cP52432 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr1cP52432 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1cP52432 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr1cP52432 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1cP52432 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1cP52432 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1cP52432 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr1cP52432 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1cP52432 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr1cP52432 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176 ms