Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa8P50706 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa8P50706 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Defa8P50706 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Defa8P50706 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Defa8P50706 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa8P50706 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa8P50706 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa8P50706 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa8P50706 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defa8P50706 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa8P50706 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Defa8P50706 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Defa8P50706 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa8P50706 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa8P50706 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Defa8P50706 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa8P50706 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa8P50706 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa8P50706 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa8P50706 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa8P50706 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa8P50706 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa8P50706 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms