Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TspoP50637 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TspoP50637 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TspoP50637 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TspoP50637 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TspoP50637 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TspoP50637 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TspoP50637 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TspoP50637 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TspoP50637 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TspoP50637 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TspoP50637 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TspoP50637 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TspoP50637 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TspoP50637 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TspoP50637 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TspoP50637 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TspoP50637 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TspoP50637 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TspoP50637 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TspoP50637 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TspoP50637 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TspoP50637 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TspoP50637 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TspoP50637 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TspoP50637 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TspoP50637 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TspoP50637 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TspoP50637 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TspoP50637 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TspoP50637 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TspoP50637 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TspoP50637 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TspoP50637 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TspoP50637 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TspoP50637 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TspoP50637 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TspoP50637 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TspoP50637 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TspoP50637 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TspoP50637 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TspoP50637 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TspoP50637 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TspoP50637 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TspoP50637 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TspoP50637 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TspoP50637 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TspoP50637 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TspoP50637 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TspoP50637 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TspoP50637 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TspoP50637 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TspoP50637 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TspoP50637 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TspoP50637 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TspoP50637 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TspoP50637 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TspoP50637 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TspoP50637 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TspoP50637 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TspoP50637 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TspoP50637 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TspoP50637 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TspoP50637 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TspoP50637 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TspoP50637 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TspoP50637 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TspoP50637 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TspoP50637 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TspoP50637 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TspoP50637 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TspoP50637 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TspoP50637 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TspoP50637 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TspoP50637 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TspoP50637 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TspoP50637 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TspoP50637 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TspoP50637 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TspoP50637 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TspoP50637 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TspoP50637 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TspoP50637 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TspoP50637 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TspoP50637 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TspoP50637 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TspoP50637 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TspoP50637 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TspoP50637 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TspoP50637 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TspoP50637 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TspoP50637 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TspoP50637 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TspoP50637 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TspoP50637 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TspoP50637 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TspoP50637 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TspoP50637 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TspoP50637 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TspoP50637 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 640.4 ms