Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psen1P49769 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psen1P49769 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Psen1P49769 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psen1P49769 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psen1P49769 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psen1P49769 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psen1P49769 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psen1P49769 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psen1P49769 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psen1P49769 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Psen1P49769 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psen1P49769 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psen1P49769 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psen1P49769 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psen1P49769 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psen1P49769 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psen1P49769 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psen1P49769 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psen1P49769 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psen1P49769 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psen1P49769 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Psen1P49769 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psen1P49769 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Psen1P49769 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psen1P49769 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psen1P49769 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psen1P49769 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psen1P49769 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psen1P49769 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psen1P49769 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psen1P49769 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psen1P49769 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psen1P49769 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psen1P49769 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psen1P49769 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psen1P49769 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psen1P49769 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psen1P49769 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Psen1P49769 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psen1P49769 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psen1P49769 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psen1P49769 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psen1P49769 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psen1P49769 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psen1P49769 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psen1P49769 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psen1P49769 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Psen1P49769 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psen1P49769 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psen1P49769 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psen1P49769 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psen1P49769 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psen1P49769 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psen1P49769 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psen1P49769 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Psen1P49769 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psen1P49769 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psen1P49769 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psen1P49769 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psen1P49769 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms