Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp3P47878 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp3P47878 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp3P47878 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms