Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pik3caP42337 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pik3caP42337 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pik3caP42337 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pik3caP42337 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pik3caP42337 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pik3caP42337 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pik3caP42337 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pik3caP42337 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pik3caP42337 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pik3caP42337 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pik3caP42337 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pik3caP42337 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3caP42337 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pik3caP42337 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pik3caP42337 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pik3caP42337 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pik3caP42337 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pik3caP42337 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms