Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Elk1P41969 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elk1P41969 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elk1P41969 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Elk1P41969 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elk1P41969 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elk1P41969 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elk1P41969 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elk1P41969 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elk1P41969 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Elk1P41969 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elk1P41969 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elk1P41969 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elk1P41969 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elk1P41969 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Elk1P41969 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Elk1P41969 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Elk1P41969 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Elk1P41969 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk1P41969 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk1P41969 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk1P41969 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk1P41969 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elk1P41969 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elk1P41969 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elk1P41969 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elk1P41969 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elk1P41969 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elk1P41969 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elk1P41969 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elk1P41969 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elk1P41969 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elk1P41969 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms