Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PpargP37238 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PpargP37238 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PpargP37238 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PpargP37238 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PpargP37238 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PpargP37238 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PpargP37238 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PpargP37238 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PpargP37238 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PpargP37238 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PpargP37238 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PpargP37238 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PpargP37238 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PpargP37238 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PpargP37238 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PpargP37238 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PpargP37238 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PpargP37238 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PpargP37238 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PpargP37238 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PpargP37238 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PpargP37238 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PpargP37238 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PpargP37238 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PpargP37238 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PpargP37238 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PpargP37238 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PpargP37238 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PpargP37238 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PpargP37238 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PpargP37238 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PpargP37238 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PpargP37238 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PpargP37238 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PpargP37238 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PpargP37238 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PpargP37238 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PpargP37238 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PpargP37238 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PpargP37238 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PpargP37238 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PpargP37238 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PpargP37238 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PpargP37238 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PpargP37238 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PpargP37238 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PpargP37238 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PpargP37238 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PpargP37238 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PpargP37238 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PpargP37238 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PpargP37238 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PpargP37238 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PpargP37238 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PpargP37238 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PpargP37238 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PpargP37238 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PpargP37238 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PpargP37238 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PpargP37238 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PpargP37238 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PpargP37238 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PpargP37238 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PpargP37238 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PpargP37238 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PpargP37238 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PpargP37238 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PpargP37238 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PpargP37238 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PpargP37238 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PpargP37238 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PpargP37238 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpargP37238 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PpargP37238 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PpargP37238 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PpargP37238 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PpargP37238 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PpargP37238 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PpargP37238 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PpargP37238 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PpargP37238 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PpargP37238 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PpargP37238 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PpargP37238 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpargP37238 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PpargP37238 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PpargP37238 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PpargP37238 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PpargP37238 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PpargP37238 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpargP37238 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpargP37238 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PpargP37238 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PpargP37238 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PpargP37238 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PpargP37238 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PpargP37238 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PpargP37238 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PpargP37238 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms