Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LdlrP35951 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LdlrP35951 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LdlrP35951 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LdlrP35951 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LdlrP35951 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LdlrP35951 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LdlrP35951 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LdlrP35951 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LdlrP35951 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LdlrP35951 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LdlrP35951 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LdlrP35951 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LdlrP35951 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LdlrP35951 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LdlrP35951 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LdlrP35951 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LdlrP35951 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LdlrP35951 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LdlrP35951 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LdlrP35951 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LdlrP35951 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LdlrP35951 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LdlrP35951 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LdlrP35951 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LdlrP35951 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LdlrP35951 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdlrP35951 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LdlrP35951 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LdlrP35951 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LdlrP35951 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LdlrP35951 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms