Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp4P35123 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp4P35123 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp4P35123 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp4P35123 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp4P35123 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp4P35123 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp4P35123 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp4P35123 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp4P35123 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp4P35123 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp4P35123 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp4P35123 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp4P35123 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp4P35123 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp4P35123 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp4P35123 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp4P35123 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp4P35123 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp4P35123 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp4P35123 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp4P35123 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp4P35123 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp4P35123 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp4P35123 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp4P35123 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp4P35123 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp4P35123 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp4P35123 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp4P35123 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp4P35123 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp4P35123 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp4P35123 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp4P35123 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp4P35123 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp4P35123 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp4P35123 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp4P35123 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp4P35123 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp4P35123 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp4P35123 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp4P35123 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp4P35123 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp4P35123 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp4P35123 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp4P35123 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp4P35123 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp4P35123 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp4P35123 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp4P35123 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp4P35123 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp4P35123 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp4P35123 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp4P35123 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp4P35123 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp4P35123 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp4P35123 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp4P35123 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms