Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Saa4P31532 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Saa4P31532 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Saa4P31532 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Saa4P31532 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Saa4P31532 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Saa4P31532 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Saa4P31532 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Saa4P31532 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Saa4P31532 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Saa4P31532 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Saa4P31532 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms