Protein–RNA interactions for Protein: P30935

Sstr3, Somatostatin receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr3P30935 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sstr3P30935 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Sstr3P30935 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sstr3P30935 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sstr3P30935 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sstr3P30935 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sstr3P30935 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sstr3P30935 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sstr3P30935 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sstr3P30935 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sstr3P30935 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sstr3P30935 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sstr3P30935 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sstr3P30935 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sstr3P30935 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sstr3P30935 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms