Protein–RNA interactions for Protein: P30275

Ckmt1, Creatine kinase U-type, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckmt1P30275 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckmt1P30275 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckmt1P30275 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckmt1P30275 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckmt1P30275 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckmt1P30275 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckmt1P30275 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckmt1P30275 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckmt1P30275 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckmt1P30275 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ckmt1P30275 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ckmt1P30275 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckmt1P30275 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ckmt1P30275 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckmt1P30275 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckmt1P30275 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckmt1P30275 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckmt1P30275 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckmt1P30275 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckmt1P30275 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ckmt1P30275 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ckmt1P30275 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ckmt1P30275 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckmt1P30275 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ckmt1P30275 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckmt1P30275 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckmt1P30275 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckmt1P30275 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckmt1P30275 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms