Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msr1P30204 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msr1P30204 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msr1P30204 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msr1P30204 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msr1P30204 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msr1P30204 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msr1P30204 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msr1P30204 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msr1P30204 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msr1P30204 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msr1P30204 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms