Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp2P29594 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp2P29594 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp2P29594 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp2P29594 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp2P29594 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp2P29594 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp2P29594 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp2P29594 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp2P29594 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp2P29594 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp2P29594 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp2P29594 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp2P29594 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp2P29594 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casp2P29594 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp2P29594 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp2P29594 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp2P29594 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp2P29594 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp2P29594 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp2P29594 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp2P29594 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms