Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Epha3P29319 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Epha3P29319 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Epha3P29319 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Epha3P29319 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Epha3P29319 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Epha3P29319 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Epha3P29319 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Epha3P29319 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Epha3P29319 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Epha3P29319 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Epha3P29319 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Epha3P29319 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Epha3P29319 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Epha3P29319 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Epha3P29319 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Epha3P29319 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Epha3P29319 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Epha3P29319 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Epha3P29319 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Epha3P29319 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Epha3P29319 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Epha3P29319 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Epha3P29319 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Epha3P29319 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Epha3P29319 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Epha3P29319 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Epha3P29319 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Epha3P29319 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Epha3P29319 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Epha3P29319 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Epha3P29319 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Epha3P29319 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Epha3P29319 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Epha3P29319 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epha3P29319 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Epha3P29319 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Epha3P29319 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Epha3P29319 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epha3P29319 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epha3P29319 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epha3P29319 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epha3P29319 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epha3P29319 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epha3P29319 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Epha3P29319 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Epha3P29319 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Epha3P29319 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Epha3P29319 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epha3P29319 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epha3P29319 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epha3P29319 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epha3P29319 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Epha3P29319 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Epha3P29319 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Epha3P29319 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Epha3P29319 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Epha3P29319 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epha3P29319 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epha3P29319 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epha3P29319 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Epha3P29319 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Epha3P29319 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epha3P29319 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Epha3P29319 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms