Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa4P28311 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa4P28311 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa4P28311 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa4P28311 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa4P28311 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa4P28311 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa4P28311 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa4P28311 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa4P28311 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa4P28311 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa4P28311 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa4P28311 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa4P28311 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa4P28311 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms