Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa2P28309 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa2P28309 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Defa2P28309 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa2P28309 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa2P28309 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa2P28309 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa2P28309 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa2P28309 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa2P28309 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa2P28309 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa2P28309 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa2P28309 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa2P28309 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa2P28309 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa2P28309 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa2P28309 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms