Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtsgP28293 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsgP28293 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsgP28293 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsgP28293 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsgP28293 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsgP28293 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsgP28293 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtsgP28293 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsgP28293 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsgP28293 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsgP28293 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsgP28293 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms