Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PdgfraP26618 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfraP26618 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PdgfraP26618 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PdgfraP26618 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PdgfraP26618 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PdgfraP26618 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PdgfraP26618 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PdgfraP26618 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PdgfraP26618 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PdgfraP26618 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PdgfraP26618 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PdgfraP26618 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PdgfraP26618 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PdgfraP26618 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdgfraP26618 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PdgfraP26618 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfraP26618 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfraP26618 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfraP26618 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdgfraP26618 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdgfraP26618 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdgfraP26618 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdgfraP26618 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms