Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bmi1P25916 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bmi1P25916 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bmi1P25916 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bmi1P25916 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bmi1P25916 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms