Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PparaP23204 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PparaP23204 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PparaP23204 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PparaP23204 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PparaP23204 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PparaP23204 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PparaP23204 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PparaP23204 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PparaP23204 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PparaP23204 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PparaP23204 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PparaP23204 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PparaP23204 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PparaP23204 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PparaP23204 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PparaP23204 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PparaP23204 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PparaP23204 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PparaP23204 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PparaP23204 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PparaP23204 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PparaP23204 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PparaP23204 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PparaP23204 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PparaP23204 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PparaP23204 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PparaP23204 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PparaP23204 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PparaP23204 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PparaP23204 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PparaP23204 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PparaP23204 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PparaP23204 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PparaP23204 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PparaP23204 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PparaP23204 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PparaP23204 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PparaP23204 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PparaP23204 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PparaP23204 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PparaP23204 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PparaP23204 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PparaP23204 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PparaP23204 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PparaP23204 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PparaP23204 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PparaP23204 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PparaP23204 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PparaP23204 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PparaP23204 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PparaP23204 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PparaP23204 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PparaP23204 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PparaP23204 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PparaP23204 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PparaP23204 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PparaP23204 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PparaP23204 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PparaP23204 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PparaP23204 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PparaP23204 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PparaP23204 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PparaP23204 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PparaP23204 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PparaP23204 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PparaP23204 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PparaP23204 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PparaP23204 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PparaP23204 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PparaP23204 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PparaP23204 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PparaP23204 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PparaP23204 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PparaP23204 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PparaP23204 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PparaP23204 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PparaP23204 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PparaP23204 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PparaP23204 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PparaP23204 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PparaP23204 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PparaP23204 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PparaP23204 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PparaP23204 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PparaP23204 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PparaP23204 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PparaP23204 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PparaP23204 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PparaP23204 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PparaP23204 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PparaP23204 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PparaP23204 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PparaP23204 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PparaP23204 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PparaP23204 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PparaP23204 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PparaP23204 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PparaP23204 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PparaP23204 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms