Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm3P21107 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpm3P21107 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpm3P21107 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm3P21107 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm3P21107 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm3P21107 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tpm3P21107 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tpm3P21107 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tpm3P21107 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpm3P21107 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm3P21107 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm3P21107 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm3P21107 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tpm3P21107 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpm3P21107 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpm3P21107 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpm3P21107 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpm3P21107 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpm3P21107 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpm3P21107 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpm3P21107 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpm3P21107 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpm3P21107 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tpm3P21107 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpm3P21107 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm3P21107 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tpm3P21107 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tpm3P21107 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpm3P21107 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm3P21107 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm3P21107 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm3P21107 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm3P21107 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpm3P21107 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm3P21107 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tpm3P21107 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpm3P21107 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpm3P21107 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpm3P21107 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpm3P21107 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpm3P21107 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpm3P21107 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm3P21107 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm3P21107 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms