Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fcer1aP20489 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fcer1aP20489 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fcer1aP20489 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fcer1aP20489 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fcer1aP20489 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fcer1aP20489 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fcer1aP20489 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fcer1aP20489 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fcer1aP20489 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fcer1aP20489 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fcer1aP20489 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fcer1aP20489 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fcer1aP20489 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fcer1aP20489 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fcer1aP20489 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcer1aP20489 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fcer1aP20489 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fcer1aP20489 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcer1aP20489 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcer1aP20489 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcer1aP20489 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms