Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pou5f1P20263 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pou5f1P20263 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pou5f1P20263 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pou5f1P20263 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pou5f1P20263 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pou5f1P20263 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pou5f1P20263 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pou5f1P20263 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pou5f1P20263 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pou5f1P20263 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pou5f1P20263 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pou5f1P20263 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pou5f1P20263 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pou5f1P20263 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pou5f1P20263 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pou5f1P20263 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pou5f1P20263 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pou5f1P20263 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pou5f1P20263 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms