Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl13aP19253 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl13aP19253 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl13aP19253 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl13aP19253 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl13aP19253 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl13aP19253 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl13aP19253 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl13aP19253 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl13aP19253 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl13aP19253 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl13aP19253 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl13aP19253 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl13aP19253 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl13aP19253 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13aP19253 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms