Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prph2P15499 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prph2P15499 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prph2P15499 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prph2P15499 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prph2P15499 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prph2P15499 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prph2P15499 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prph2P15499 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prph2P15499 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prph2P15499 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prph2P15499 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prph2P15499 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prph2P15499 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prph2P15499 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prph2P15499 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prph2P15499 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prph2P15499 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prph2P15499 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prph2P15499 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prph2P15499 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prph2P15499 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prph2P15499 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prph2P15499 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prph2P15499 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prph2P15499 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prph2P15499 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prph2P15499 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prph2P15499 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prph2P15499 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prph2P15499 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prph2P15499 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prph2P15499 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prph2P15499 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms