Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd44P15379 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd44P15379 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd44P15379 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd44P15379 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd44P15379 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd44P15379 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd44P15379 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cd44P15379 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd44P15379 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd44P15379 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd44P15379 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd44P15379 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cd44P15379 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cd44P15379 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cd44P15379 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd44P15379 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd44P15379 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd44P15379 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd44P15379 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd44P15379 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cd44P15379 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cd44P15379 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd44P15379 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cd44P15379 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cd44P15379 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cd44P15379 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cd44P15379 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cd44P15379 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cd44P15379 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd44P15379 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd44P15379 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd44P15379 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd44P15379 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd44P15379 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd44P15379 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd44P15379 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd44P15379 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd44P15379 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd44P15379 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd44P15379 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cd44P15379 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cd44P15379 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cd44P15379 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cd44P15379 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cd44P15379 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cd44P15379 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cd44P15379 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cd44P15379 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cd44P15379 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cd44P15379 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cd44P15379 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cd44P15379 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms