Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RpsaP14206 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RpsaP14206 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpsaP14206 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RpsaP14206 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RpsaP14206 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RpsaP14206 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RpsaP14206 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RpsaP14206 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RpsaP14206 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RpsaP14206 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RpsaP14206 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RpsaP14206 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RpsaP14206 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RpsaP14206 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RpsaP14206 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RpsaP14206 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RpsaP14206 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RpsaP14206 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpsaP14206 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RpsaP14206 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RpsaP14206 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RpsaP14206 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpsaP14206 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RpsaP14206 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RpsaP14206 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RpsaP14206 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RpsaP14206 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms