Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd1d1P11609 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd1d1P11609 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd1d1P11609 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd1d1P11609 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cd1d1P11609 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd1d1P11609 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd1d1P11609 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd1d1P11609 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd1d1P11609 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd1d1P11609 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd1d1P11609 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd1d1P11609 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd1d1P11609 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms