Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem254aP0DN89 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem254aP0DN89 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem254aP0DN89 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem254aP0DN89 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254aP0DN89 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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