Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P06335 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P06335 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P06335 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P06335 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P06335 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P06335 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P06335 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P06335 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P06335 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P06335 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P06335 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P06335 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P06335 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P06335 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P06335 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P06335 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P06335 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P06335 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P06335 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P06335 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P06335 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P06335 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P06335 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P06335 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P06335 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P06335 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
P06335 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P06335 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P06335 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P06335 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P06335 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P06335 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P06335 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P06335 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P06335 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
P06335 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P06335 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P06335 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P06335 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P06335 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P06335 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P06335 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06335 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06335 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06335 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
P06335 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06335 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06335 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06335 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06335 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06335 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06335 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06335 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06335 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06335 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06335 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06335 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06335 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06335 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06335 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06335 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06335 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06335 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06335 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
P06335 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06335 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06335 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06335 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06335 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06335 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06335 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06335 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06335 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06335 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06335 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06335 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06335 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06335 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06335 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06335 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06335 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06335 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06335 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P06335 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06335 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06335 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06335 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P06335 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P06335 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P06335 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P06335 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P06335 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P06335 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06335 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06335 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06335 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06335 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P06335 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P06335 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms