Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mtnd1P03888 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtnd1P03888 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtnd1P03888 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mtnd1P03888 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mtnd1P03888 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtnd1P03888 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtnd1P03888 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms