Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-AaP01910 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2-AaP01910 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-AaP01910 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-AaP01910 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-AaP01910 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-AaP01910 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-AaP01910 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-AaP01910 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-AaP01910 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-AaP01910 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-AaP01910 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-AaP01910 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-AaP01910 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-AaP01910 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-AaP01910 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-AaP01910 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-AaP01910 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-AaP01910 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-AaP01910 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-AaP01910 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-AaP01910 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-AaP01910 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-AaP01910 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-AaP01910 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-AaP01910 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-AaP01910 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-AaP01910 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-AaP01910 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-AaP01910 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms