Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01791 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01791 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01791 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01791 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01791 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01791 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01791 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01791 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01791 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01791 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01791 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01791 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01791 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01791 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01791 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01791 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01791 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01791 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01791 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01791 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01791 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01791 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01791 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01791 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01791 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01791 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01791 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01791 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01791 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01791 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01791 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01791 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01791 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01791 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01791 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01791 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01791 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01791 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01791 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01791 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01791 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01791 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01791 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01791 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01791 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01791 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01791 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01791 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01791 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01791 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01791 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01791 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01791 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01791 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01791 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01791 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01791 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01791 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01791 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01791 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01791 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01791 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01791 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01791 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01791 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01791 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01791 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01791 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01791 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01791 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01791 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01791 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01791 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01791 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01791 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01791 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01791 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01791 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01791 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01791 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01791 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01791 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01791 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01791 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01791 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01791 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01791 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01791 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01791 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01791 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01791 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01791 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms