Protein–RNA interactions for Protein: O88951

Lin7b, Protein lin-7 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7bO88951 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lin7bO88951 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lin7bO88951 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lin7bO88951 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lin7bO88951 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lin7bO88951 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lin7bO88951 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lin7bO88951 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lin7bO88951 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lin7bO88951 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lin7bO88951 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lin7bO88951 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lin7bO88951 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lin7bO88951 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lin7bO88951 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lin7bO88951 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lin7bO88951 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lin7bO88951 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lin7bO88951 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lin7bO88951 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lin7bO88951 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lin7bO88951 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lin7bO88951 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lin7bO88951 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lin7bO88951 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lin7bO88951 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms