Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacng2O88602 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacng2O88602 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacng2O88602 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacng2O88602 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacng2O88602 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms