Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops4O88544 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops4O88544 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops4O88544 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops4O88544 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops4O88544 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops4O88544 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops4O88544 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops4O88544 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops4O88544 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cops4O88544 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cops4O88544 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cops4O88544 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cops4O88544 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops4O88544 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops4O88544 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops4O88544 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops4O88544 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cops4O88544 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops4O88544 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops4O88544 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops4O88544 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms