Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh16O88338 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh16O88338 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh16O88338 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh16O88338 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh16O88338 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh16O88338 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh16O88338 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh16O88338 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh16O88338 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh16O88338 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdh16O88338 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh16O88338 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh16O88338 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh16O88338 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh16O88338 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh16O88338 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh16O88338 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh16O88338 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh16O88338 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdh16O88338 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh16O88338 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh16O88338 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh16O88338 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh16O88338 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh16O88338 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms