Protein–RNA interactions for Protein: O70274

Ptp4a2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a2O70274 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptp4a2O70274 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptp4a2O70274 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptp4a2O70274 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ptp4a2O70274 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ptp4a2O70274 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptp4a2O70274 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptp4a2O70274 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptp4a2O70274 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptp4a2O70274 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ptp4a2O70274 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptp4a2O70274 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptp4a2O70274 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ptp4a2O70274 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ptp4a2O70274 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ptp4a2O70274 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptp4a2O70274 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptp4a2O70274 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptp4a2O70274 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptp4a2O70274 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptp4a2O70274 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptp4a2O70274 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms