Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sap18O55128 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sap18O55128 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sap18O55128 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sap18O55128 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sap18O55128 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sap18O55128 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sap18O55128 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sap18O55128 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sap18O55128 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Sap18O55128 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sap18O55128 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sap18O55128 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sap18O55128 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sap18O55128 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sap18O55128 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sap18O55128 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sap18O55128 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sap18O55128 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sap18O55128 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sap18O55128 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sap18O55128 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sap18O55128 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sap18O55128 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sap18O55128 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sap18O55128 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sap18O55128 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sap18O55128 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms