Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsm2O35900 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsm2O35900 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsm2O35900 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm2O35900 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm2O35900 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm2O35900 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsm2O35900 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsm2O35900 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm2O35900 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsm2O35900 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm2O35900 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm2O35900 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm2O35900 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm2O35900 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm2O35900 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm2O35900 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm2O35900 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lsm2O35900 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm2O35900 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm2O35900 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm2O35900 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm2O35900 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm2O35900 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm2O35900 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm2O35900 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm2O35900 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm2O35900 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lsm2O35900 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm2O35900 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsm2O35900 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms